Hallitus
Seuran asioita ja omaisuutta hoitaa vuosikokouksen valitsema hallitus, jonka muodostavat seuran puheenjohtaja, varapuheenjohtaja ja kuusi muuta jäsentä. Jäsenet valitaan vuodeksi kerrallaan.

Vuonna 2012 (valittu vuosikokouksessa 14.3.2012) Suomen fyysikkoseuran hallitukseen kuuluvat:

prof. Ritva Serimaa, puheenjohtaja (Helsingin yliopisto)
prof. Jorma Jokiniemi, varapj. (Itä-Suomen yliopisto ja Teknologian tutkimuskeskus VTT)
prof. Markus Ahlskog (Jyväskylän yliopisto)
akatemiatutkija Jaakko Akola (Tampereen teknillinen yliopisto)
dos. Sami Heinäsmäki (Oulun yliopisto)
dos. Hanne Ludvigsen (Aalto-yliopisto)
prof. Petriina Paturi (Turun yliopisto)
TkT Jari Penttilä (Aivon Oy)